Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY4

ARHGAP35, Rho GTPase-activating protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP35Q9NRY4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGAP35Q9NRY4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGAP35Q9NRY4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGAP35Q9NRY4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGAP35Q9NRY4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGAP35Q9NRY4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGAP35Q9NRY4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGAP35Q9NRY4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGAP35Q9NRY4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGAP35Q9NRY4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGAP35Q9NRY4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGAP35Q9NRY4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGAP35Q9NRY4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGAP35Q9NRY4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGAP35Q9NRY4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGAP35Q9NRY4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGAP35Q9NRY4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGAP35Q9NRY4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGAP35Q9NRY4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGAP35Q9NRY4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGAP35Q9NRY4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGAP35Q9NRY4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGAP35Q9NRY4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGAP35Q9NRY4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGAP35Q9NRY4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGAP35Q9NRY4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGAP35Q9NRY4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGAP35Q9NRY4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGAP35Q9NRY4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGAP35Q9NRY4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGAP35Q9NRY4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGAP35Q9NRY4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGAP35Q9NRY4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGAP35Q9NRY4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGAP35Q9NRY4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGAP35Q9NRY4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGAP35Q9NRY4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGAP35Q9NRY4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGAP35Q9NRY4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARHGAP35Q9NRY4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms