Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX15Q9NRS6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms