Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOPCQ9HD26 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms