Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZC3H12CQ9C0D7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC3H12CQ9C0D7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC3H12CQ9C0D7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC3H12CQ9C0D7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC3H12CQ9C0D7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC3H12CQ9C0D7 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC3H12CQ9C0D7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC3H12CQ9C0D7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC3H12CQ9C0D7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC3H12CQ9C0D7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC3H12CQ9C0D7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC3H12CQ9C0D7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC3H12CQ9C0D7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC3H12CQ9C0D7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC3H12CQ9C0D7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC3H12CQ9C0D7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC3H12CQ9C0D7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC3H12CQ9C0D7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC3H12CQ9C0D7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC3H12CQ9C0D7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC3H12CQ9C0D7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC3H12CQ9C0D7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC3H12CQ9C0D7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC3H12CQ9C0D7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC3H12CQ9C0D7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC3H12CQ9C0D7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC3H12CQ9C0D7 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC3H12CQ9C0D7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC3H12CQ9C0D7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC3H12CQ9C0D7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms