Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms