Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRRTQ9BXP5 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms