Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPA33Q99795 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPA33Q99795 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPA33Q99795 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPA33Q99795 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPA33Q99795 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPA33Q99795 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPA33Q99795 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPA33Q99795 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GPA33Q99795 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPA33Q99795 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPA33Q99795 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPA33Q99795 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPA33Q99795 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPA33Q99795 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPA33Q99795 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPA33Q99795 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GPA33Q99795 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPA33Q99795 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPA33Q99795 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms