Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LMTK3Q96Q04 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms