Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms