Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms