Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AVL9Q8NBF6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms