Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms