Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HECW1Q76N89 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
HECW1Q76N89 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HECW1Q76N89 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HECW1Q76N89 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HECW1Q76N89 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HECW1Q76N89 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HECW1Q76N89 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HECW1Q76N89 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HECW1Q76N89 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HECW1Q76N89 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
HECW1Q76N89 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HECW1Q76N89 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HECW1Q76N89 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HECW1Q76N89 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HECW1Q76N89 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HECW1Q76N89 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HECW1Q76N89 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HECW1Q76N89 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HECW1Q76N89 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HECW1Q76N89 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HECW1Q76N89 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HECW1Q76N89 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HECW1Q76N89 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
HECW1Q76N89 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HECW1Q76N89 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HECW1Q76N89 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
HECW1Q76N89 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HECW1Q76N89 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HECW1Q76N89 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
HECW1Q76N89 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HECW1Q76N89 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HECW1Q76N89 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HECW1Q76N89 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HECW1Q76N89 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HECW1Q76N89 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HECW1Q76N89 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HECW1Q76N89 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HECW1Q76N89 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HECW1Q76N89 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HECW1Q76N89 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HECW1Q76N89 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms