Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSSK4Q6SA08 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms