Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZBED9Q6R2W3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED9Q6R2W3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms