Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KHDC3LQ587J8 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KHDC3LQ587J8 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms