Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP28Q4G0W2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms