Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms