Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms