Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
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