Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ALX1Q15699 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms