Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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