Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms