Protein–RNA interactions for Protein: Q13363

CTBP1, C-terminal-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1Q13363 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTBP1Q13363 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms