Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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SKP2Q13309 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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SKP2Q13309 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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SKP2Q13309 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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SKP2Q13309 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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SKP2Q13309 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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SKP2Q13309 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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SKP2Q13309 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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SKP2Q13309 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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