Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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