Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NrepQ07475 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NrepQ07475 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NrepQ07475 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NrepQ07475 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NrepQ07475 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NrepQ07475 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NrepQ07475 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NrepQ07475 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NrepQ07475 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NrepQ07475 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
NrepQ07475 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms