Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms