Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLTCQ00610 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms