Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDKL1Q00532 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDKL1Q00532 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDKL1Q00532 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDKL1Q00532 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDKL1Q00532 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDKL1Q00532 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDKL1Q00532 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDKL1Q00532 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKL1Q00532 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms