Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNB1P98172 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms