Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SNAP25P60880 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms