Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRCA2P51587 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms