Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ETV1P50549 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ETV1P50549 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ETV1P50549 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ETV1P50549 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ETV1P50549 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ETV1P50549 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV1P50549 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV1P50549 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV1P50549 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV1P50549 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV1P50549 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV1P50549 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV1P50549 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV1P50549 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV1P50549 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV1P50549 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV1P50549 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV1P50549 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV1P50549 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV1P50549 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV1P50549 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV1P50549 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV1P50549 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV1P50549 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV1P50549 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV1P50549 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV1P50549 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV1P50549 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV1P50549 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV1P50549 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV1P50549 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV1P50549 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV1P50549 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV1P50549 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV1P50549 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV1P50549 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV1P50549 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV1P50549 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV1P50549 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV1P50549 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV1P50549 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ETV1P50549 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ETV1P50549 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV1P50549 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV1P50549 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV1P50549 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV1P50549 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV1P50549 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV1P50549 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV1P50549 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV1P50549 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV1P50549 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV1P50549 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV1P50549 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV1P50549 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV1P50549 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV1P50549 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV1P50549 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV1P50549 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV1P50549 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV1P50549 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV1P50549 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV1P50549 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV1P50549 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV1P50549 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV1P50549 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV1P50549 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV1P50549 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV1P50549 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV1P50549 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV1P50549 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV1P50549 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV1P50549 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV1P50549 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV1P50549 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV1P50549 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV1P50549 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV1P50549 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV1P50549 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV1P50549 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV1P50549 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV1P50549 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ETV1P50549 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV1P50549 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV1P50549 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV1P50549 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV1P50549 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV1P50549 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV1P50549 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV1P50549 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV1P50549 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV1P50549 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV1P50549 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV1P50549 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV1P50549 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV1P50549 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV1P50549 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV1P50549 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ETV1P50549 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms