Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRIM1P49642 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms