Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms