Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms