Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRIP1P48552 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms