Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ARL1P40616 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARL1P40616 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARL1P40616 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARL1P40616 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARL1P40616 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ARL1P40616 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ARL1P40616 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ARL1P40616 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARL1P40616 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARL1P40616 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARL1P40616 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARL1P40616 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARL1P40616 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARL1P40616 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARL1P40616 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARL1P40616 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARL1P40616 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARL1P40616 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARL1P40616 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARL1P40616 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARL1P40616 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARL1P40616 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARL1P40616 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARL1P40616 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL1P40616 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL1P40616 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL1P40616 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL1P40616 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL1P40616 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL1P40616 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL1P40616 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL1P40616 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL1P40616 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL1P40616 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL1P40616 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL1P40616 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL1P40616 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL1P40616 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL1P40616 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL1P40616 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL1P40616 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL1P40616 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL1P40616 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL1P40616 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL1P40616 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL1P40616 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL1P40616 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL1P40616 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL1P40616 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL1P40616 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL1P40616 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL1P40616 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL1P40616 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL1P40616 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL1P40616 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL1P40616 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL1P40616 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL1P40616 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL1P40616 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL1P40616 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARL1P40616 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARL1P40616 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARL1P40616 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARL1P40616 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARL1P40616 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARL1P40616 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ARL1P40616 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARL1P40616 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARL1P40616 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARL1P40616 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARL1P40616 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARL1P40616 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARL1P40616 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARL1P40616 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARL1P40616 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARL1P40616 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARL1P40616 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARL1P40616 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL1P40616 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL1P40616 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL1P40616 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL1P40616 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL1P40616 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL1P40616 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL1P40616 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL1P40616 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL1P40616 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL1P40616 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL1P40616 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL1P40616 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL1P40616 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL1P40616 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL1P40616 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL1P40616 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL1P40616 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL1P40616 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL1P40616 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL1P40616 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL1P40616 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms