Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP6P35125 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP6P35125 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP6P35125 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP6P35125 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP6P35125 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP6P35125 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP6P35125 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
USP6P35125 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
USP6P35125 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP6P35125 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP6P35125 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP6P35125 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP6P35125 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
USP6P35125 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
USP6P35125 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP6P35125 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP6P35125 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP6P35125 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP6P35125 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
USP6P35125 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP6P35125 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP6P35125 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP6P35125 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP6P35125 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP6P35125 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP6P35125 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP6P35125 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP6P35125 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP6P35125 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP6P35125 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP6P35125 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP6P35125 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP6P35125 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP6P35125 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP6P35125 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP6P35125 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP6P35125 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP6P35125 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP6P35125 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP6P35125 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP6P35125 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP6P35125 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP6P35125 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP6P35125 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP6P35125 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP6P35125 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP6P35125 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP6P35125 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP6P35125 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP6P35125 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
USP6P35125 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP6P35125 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP6P35125 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
USP6P35125 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP6P35125 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP6P35125 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP6P35125 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP6P35125 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP6P35125 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP6P35125 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP6P35125 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP6P35125 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
USP6P35125 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP6P35125 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP6P35125 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP6P35125 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
USP6P35125 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP6P35125 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
USP6P35125 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP6P35125 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP6P35125 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP6P35125 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP6P35125 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP6P35125 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP6P35125 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP6P35125 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP6P35125 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP6P35125 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP6P35125 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
USP6P35125 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP6P35125 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP6P35125 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP6P35125 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP6P35125 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP6P35125 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP6P35125 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP6P35125 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP6P35125 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP6P35125 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP6P35125 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP6P35125 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP6P35125 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP6P35125 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP6P35125 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP6P35125 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP6P35125 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP6P35125 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP6P35125 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP6P35125 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms