Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC008799.2-201ENST00000484429 647 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 AC022400.7-201ENST00000625041 1236 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 AC093915.1-201ENST00000605740 1543 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXD11P31277 CYB5A-201ENST00000299438 718 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 HAUS1P2-201ENST00000439908 784 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 RN7SKP105-201ENST00000517192 314 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 AL163195.2-203ENST00000553604 573 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 AC011939.1-201ENST00000567680 964 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 AC007346.1-202ENST00000602826 684 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 AC236972.3-202ENST00000620734 1222 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 METTL5-203ENST00000392640 800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 AC097478.3-201ENST00000620420 872 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 AL162574.3-201ENST00000623209 612 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 SIRT4-201ENST00000202967 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 ARPC3-201ENST00000228825 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 HNF4GP1-201ENST00000430567 1249 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD11P31277 AL732372.2-201ENST00000431321 437 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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