Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD34P28906 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD34P28906 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD34P28906 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD34P28906 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD34P28906 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD34P28906 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD34P28906 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD34P28906 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD34P28906 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CD34P28906 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD34P28906 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD34P28906 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD34P28906 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD34P28906 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD34P28906 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD34P28906 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD34P28906 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD34P28906 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD34P28906 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD34P28906 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CD34P28906 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD34P28906 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD34P28906 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD34P28906 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD34P28906 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD34P28906 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD34P28906 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD34P28906 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD34P28906 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD34P28906 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD34P28906 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD34P28906 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD34P28906 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD34P28906 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD34P28906 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD34P28906 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD34P28906 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD34P28906 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD34P28906 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD34P28906 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD34P28906 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD34P28906 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD34P28906 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD34P28906 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD34P28906 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD34P28906 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD34P28906 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD34P28906 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD34P28906 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD34P28906 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD34P28906 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD34P28906 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD34P28906 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD34P28906 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD34P28906 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD34P28906 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD34P28906 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CD34P28906 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD34P28906 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD34P28906 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD34P28906 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD34P28906 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD34P28906 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD34P28906 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD34P28906 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD34P28906 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD34P28906 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD34P28906 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD34P28906 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD34P28906 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD34P28906 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD34P28906 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD34P28906 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD34P28906 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD34P28906 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CD34P28906 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD34P28906 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD34P28906 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms