Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HTR2AP28223 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms