Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FGFR3P22607 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGFR3P22607 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGFR3P22607 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGFR3P22607 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGFR3P22607 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGFR3P22607 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGFR3P22607 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGFR3P22607 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGFR3P22607 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGFR3P22607 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGFR3P22607 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGFR3P22607 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FGFR3P22607 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGFR3P22607 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGFR3P22607 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGFR3P22607 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGFR3P22607 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGFR3P22607 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FGFR3P22607 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGFR3P22607 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGFR3P22607 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGFR3P22607 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGFR3P22607 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGFR3P22607 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGFR3P22607 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGFR3P22607 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGFR3P22607 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FGFR3P22607 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FGFR3P22607 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms