Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTN1P12814 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN1P12814 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms