Protein–RNA interactions for Protein: P02462

COL4A1, Collagen alpha-1(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A1P02462 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL4A1P02462 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A1P02462 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A1P02462 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A1P02462 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A1P02462 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A1P02462 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A1P02462 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A1P02462 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A1P02462 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A1P02462 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A1P02462 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A1P02462 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A1P02462 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A1P02462 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A1P02462 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A1P02462 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A1P02462 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A1P02462 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COL4A1P02462 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A1P02462 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A1P02462 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A1P02462 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A1P02462 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A1P02462 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A1P02462 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A1P02462 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A1P02462 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A1P02462 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A1P02462 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A1P02462 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A1P02462 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A1P02462 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A1P02462 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A1P02462 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A1P02462 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A1P02462 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A1P02462 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL4A1P02462 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A1P02462 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A1P02462 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A1P02462 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A1P02462 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A1P02462 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms