Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
BBOX1O75936 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BBOX1O75936 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms