Protein–RNA interactions for Protein: O75923

DYSF, Dysferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,080 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYSFO75923 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DYSFO75923 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DYSFO75923 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DYSFO75923 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DYSFO75923 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DYSFO75923 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DYSFO75923 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DYSFO75923 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DYSFO75923 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DYSFO75923 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DYSFO75923 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DYSFO75923 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DYSFO75923 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DYSFO75923 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DYSFO75923 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DYSFO75923 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DYSFO75923 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DYSFO75923 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DYSFO75923 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DYSFO75923 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DYSFO75923 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DYSFO75923 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DYSFO75923 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DYSFO75923 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DYSFO75923 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DYSFO75923 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DYSFO75923 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DYSFO75923 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DYSFO75923 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DYSFO75923 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DYSFO75923 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DYSFO75923 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DYSFO75923 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DYSFO75923 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DYSFO75923 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DYSFO75923 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DYSFO75923 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DYSFO75923 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DYSFO75923 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DYSFO75923 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DYSFO75923 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DYSFO75923 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DYSFO75923 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DYSFO75923 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DYSFO75923 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DYSFO75923 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DYSFO75923 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DYSFO75923 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DYSFO75923 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DYSFO75923 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DYSFO75923 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DYSFO75923 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DYSFO75923 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DYSFO75923 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DYSFO75923 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DYSFO75923 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DYSFO75923 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DYSFO75923 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DYSFO75923 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DYSFO75923 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DYSFO75923 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DYSFO75923 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DYSFO75923 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DYSFO75923 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DYSFO75923 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DYSFO75923 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DYSFO75923 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DYSFO75923 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DYSFO75923 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DYSFO75923 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DYSFO75923 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DYSFO75923 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DYSFO75923 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DYSFO75923 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DYSFO75923 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DYSFO75923 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DYSFO75923 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DYSFO75923 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DYSFO75923 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DYSFO75923 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DYSFO75923 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DYSFO75923 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DYSFO75923 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DYSFO75923 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DYSFO75923 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DYSFO75923 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DYSFO75923 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DYSFO75923 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DYSFO75923 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DYSFO75923 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DYSFO75923 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DYSFO75923 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DYSFO75923 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DYSFO75923 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DYSFO75923 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DYSFO75923 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DYSFO75923 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DYSFO75923 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DYSFO75923 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DYSFO75923 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms