Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COCHO43405 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COCHO43405 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COCHO43405 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COCHO43405 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COCHO43405 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COCHO43405 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COCHO43405 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COCHO43405 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COCHO43405 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COCHO43405 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COCHO43405 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COCHO43405 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COCHO43405 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COCHO43405 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COCHO43405 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COCHO43405 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COCHO43405 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COCHO43405 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COCHO43405 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COCHO43405 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
COCHO43405 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COCHO43405 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COCHO43405 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COCHO43405 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COCHO43405 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COCHO43405 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COCHO43405 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COCHO43405 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COCHO43405 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COCHO43405 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COCHO43405 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COCHO43405 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COCHO43405 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COCHO43405 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COCHO43405 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COCHO43405 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COCHO43405 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
COCHO43405 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COCHO43405 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COCHO43405 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COCHO43405 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COCHO43405 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COCHO43405 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
COCHO43405 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COCHO43405 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
COCHO43405 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
COCHO43405 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COCHO43405 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COCHO43405 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COCHO43405 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COCHO43405 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
COCHO43405 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
COCHO43405 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COCHO43405 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COCHO43405 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COCHO43405 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COCHO43405 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COCHO43405 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COCHO43405 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COCHO43405 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COCHO43405 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COCHO43405 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COCHO43405 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COCHO43405 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COCHO43405 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COCHO43405 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COCHO43405 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COCHO43405 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COCHO43405 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COCHO43405 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COCHO43405 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COCHO43405 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COCHO43405 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COCHO43405 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COCHO43405 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COCHO43405 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COCHO43405 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COCHO43405 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COCHO43405 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COCHO43405 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COCHO43405 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COCHO43405 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COCHO43405 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COCHO43405 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COCHO43405 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COCHO43405 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COCHO43405 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COCHO43405 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COCHO43405 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COCHO43405 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COCHO43405 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COCHO43405 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COCHO43405 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COCHO43405 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COCHO43405 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COCHO43405 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COCHO43405 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COCHO43405 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COCHO43405 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms