Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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